植物品种鉴定 MNP标记法pdf下载|百度网盘下载

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植物品种鉴定的MNP标记方法，本标准规定了植物品种鉴定的多核苷酸多态性（MNP）标记方法的原理、试剂或材料、设备、测定步骤及结果分析。

前言

本标准按照GB/T 1.1-2009给出的规则起草。

本标准由中国标准化研究院提出并归口。

本标准起草单位：江汉大学、武汉明流生物科技有限公司、中国标准化研究院、农业农村部科技发展中心、北京工商大学、蔬菜研究中心北京农林科学院、湖南杂交水稻研究中心、华南农业大学、张家口农科院、深圳华大智造科技有限公司

本标准主要起草人：彭海、方志伟、李伦、马爱金、周俊飞、文昌龙、李甜甜、唐昊、陈红、崔业涵、张嘉楠、贾英敏、徐娜、宋舒峰、胡美霞、傅希钦、赵志海、梁勇、徐振江、高丽芬、陈立宏、韩瑞熙、张蝶、张静、于金文。

范围

本标准规定了植物品种鉴定中多核苷酸多态性（MNP）标记法的原理、试剂或材料、仪器设备、测定步骤及结果分析。

本标准适用于水稻(Oryza sativa L.)、玉米(Zea mays L.)、大豆[Glycine mar (Linn.) Merr.]、棉花(Gossypium spp.)、花生(Arachis hypogaea L.)、小米 (Setaria italica)、西瓜 (Citrullus lanatus)、甜瓜 (Cacumis melo L.)、黄瓜 (C'acumis sativus L.)、艾草 (Artemisia argyi)、番茄 (L. ycopersicon esculen-

tum Mill.)、辣椒 (Capsicum annuum L.)、卷心菜 [Brassica pekinensis (Lour.) Rupr.]、龙眼 (Dimocarpus longan Lour.)、荔枝 (Litchi chinensis Sonn.)、猕猴桃 (Actinidia Chinensis) 鉴定原始品种鉴定、实质衍生品种鉴定和品种真伪鉴定。其他植物品种的鉴定可参照本标准。

测序数据质量控制

数据质量控制如下：使用MILMNP品种鉴定软件将样本测序数据与参考基因组的标记位点进行比对，统计首次检测到的标记位点的平均覆盖度Ci；

-当C小于500时，判断样本测序数据量不足，从步骤7.5或之前的标记位点平均覆盖率到重新实验的第一次检测， C，大于等于500；

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-当C,大于等于500时，进一步计算检测到的marker位点的比值R，-7，其中T和T分别为检测到的marker位点个数和样本的检测到的marker个数网站数量；

-当R大于等于95%时，判断测序数据合格；

-当R小于95%时，判断建库可能失败，从7.3或之前的步骤重新实验到第二次检测的标记位点的平均覆盖率C大于或等于 500；一次C：大于等于500时，进一步计算第一个和第二个共同检测标记位点的比值R：=

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7T，其中T为第一次和第二次检测到的标记位点数，T和T2分别为第一次和第二次检测到的标记位点数：

-当R：大于等于95%时，判断测序数据合格。